到了清代康乾盛世，古琴音樂的中心，逐步轉向了同為江南古城之淮揚地區。各地的文人墨客也相繼云集廣陵，琴壇名家薈萃，人才輩出。一個新的琴派——“廣陵派”亦終于形成，成為清代中期以后影響最為廣泛的琴派之一，其琴樂的傳承一直延續至今。

　　廣陵派以清初揚州琴家徐常遇為開山鼻祖，他編有《澄鑒堂琴譜》。其后，揚州著名的琴家徐祺、徐俊父子，編著了《五知齋琴譜》，這是近300年來在琴壇流傳最廣的一本琴譜。此譜以虞山派之清淡和雅為基礎，繼而融入吳派的婉轉含蓄，金陵派的抑揚頓挫，蜀派之剛勁豪邁，中州派之高古端嚴，并最終形成跌宕細膩、恬逸灑脫的風格，為古琴音樂的繼承與發展提供了一個很好的范例。

　　清代中期以后，出現了琴派紛呈的局面。其中著名的有諸城派、閩派、川派、嶺南派等等。同時隨著印刷技術的日益精湛，清代刊印琴譜之風也十分盛行。各琴派均有自己不同的傳譜。其中較著名的除了《澄鑒堂琴譜》（1686年，徐常遇編）、《五知齋琴譜》（1772年，徐祺編）外，還有《自遠堂琴譜》（1802年，吳灴編）、《蕉庵琴譜》（1868年，秦維翰編）等等，而其中所記錄的琴曲，是一筆巨大的音樂財富；

　　古琴作為一種文人音樂，它的發展必然受到各個時代士大夫觀念和審美的影響。唐和唐以前的琴曲，多右手繁聲，講究的是如《廣陵散》、《離騷》等琴曲中體現的氣勢、力度和節奏。明清時期，由于受昆曲及其它戲曲音樂的影響，古琴的演奏技術也有了重要的變化。尤其是左手技法更趨細膩、生動。如《五知齋琴譜》中的《瀟湘水云》、《胡笳十八拍》等琴曲，其左手吟猱綽注的運用已相當豐富。